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title: Pour application du modèle colBiSBM sur données interaction PP et pratiques agricoles
categories:
  - application
  - agricole
  - graphe
  - collection
  - lbm
  - sbm
author:
  - Louis Lacoste
  - Alizée Geffroy
  - Jean Cohen
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{{< include /_macros.tex >}}

# TODO

- [ ] Écrire un script pour télécharger les données des diverses sources
- [ ] Écrire un script de prétraitement des données pour les mettre au bon format
- [ ] Appliquer colBiSBM sur les réseaux

# Idée de l'application

En discutant avec Alizée et grâce aux ressources de la [section "Liens" données par Jean](#liens) possible d'essayer de voir l'impact sur la structure des réseaux plantes-pollinisateurs des pratiques agricoles autour des espaces de pollinisation.

# Point à éclaircir

1. Quels réseaux plantes-pollinisateurs choisir, où les trouver ? Besoin de réseaux en France pour la facilité.

2. Faut-il utiliser les covariables seulement de manière *post-hoc* pour corréler avec le *clustering* de réseaux obtenus ?

3. Comment encoder les covariables ?
- Est-ce que je les mets sous forme de pourcentage dans un *buffer* (quel rayon ?) comme Jean ? Alors problèmes inhérents aux données compositionnelles mais facilité d'exécution ?
- Quelle distance considérer pour l'impact des pratiques agricoles, distance variables par pollinisateurs en soit ? Besoin de connaissances expertes.
- Besoin d'homogénéiser les échelles ? Ou a minima d'en choisir une ou plusieurs à considérer pour les covariables ?
- Gestion de gros tableaux de données pas simple.
1. **Le temps ???**

# Liens

CORINE Land Cover et extraction en R

Très gros grain :

<https://fr.wikipedia.org/wiki/Corine_Land_Cover> et le package de Jean pour l'extraction des *buffers* de types d'utilisation des sols :

<https://github.com/jean-cohen/corine.land.cover.landuse.extraction>

Les cartes de données :

- Carte du Bio et des types de cultures échelle parcelle : <https://www.agencebio.org/cartobio/>

- Échelle code postal, achat de phytosanitaires : <https://ventes-produits-phytopharmaceutiques.eaufrance.fr/>

- Thèse de Milena Cairo, classification des parcelles selon les pratiques en pesticides : <https://theses.hal.science/tel-05038286>

- Recensement des parcelles et du type de culture : <https://cartes.gouv.fr/rechercher-une-donnee/dataset/IGNF_RPG?redirected_from=geoservices.ign.fr>
