Ajout de vrai données pour la simulation

R/realTree.R

@@ -1,8 +0,0 @@
-# TODO with real tree
-# Source : https://genome.cshlp.org/content/29/1/53
-# Normaliser l'arbre
-
-# Mus et Rat vs le reste
-
-# Groupes équilibëes
-

R/realTreeMethod.R

@@ -0,0 +1,2 @@
+# TODO appliquer Satterthwaite, et calcule les pvalues pour les 5000 genes
+# avec Correction Bonferroni et Benjamini-Hochberg (voir Livre Christophe Giraud)

R/realTreeSimu.R

@@ -0,0 +1,16 @@
+# TODO with real tree
+# Source : https://genome.cshlp.org/content/29/1/53
+# Normaliser l'arbre
+require("ape")
+require("phylolm")
+require("phytools")
+
+tree <- read.tree("./R/chen2019.tree")
+tree <- read.tree("./data/data_TER/data_raw/mammals_tree_chen2019.tree")
+
+plotTree(tree)
+
+# Mus et Rat vs le reste
+
+# Groupes équilibrës
+