diff --git a/code/scripts/migale_application_weboflife.sh b/code/scripts/migale_application_weboflife.sh new file mode 100755 index 0000000..d7eac3c --- /dev/null +++ b/code/scripts/migale_application_weboflife.sh @@ -0,0 +1,31 @@ +#!/usr/bin/env bash +#$ -V +#$ -cwd +#$ -N weboflife_app +#$ -m besa +#$ -t 1:4 +#$ -q long.q +#$ -pe thread 64 +#$ -M louis.lacoste+migale@agroparistech.fr +#$ -o logs/$JOB_NAME.$TASK_ID +#$ -e logs/$JOB_NAME.$TASK_ID + +# Creating log directory if it doesn't exists +BASE_DIR="/home/$USER/work/mia-stage-2024" +LOG_DIR=$(echo "$BASE_DIR/logs") + +if [ ! -d "$LOG_DIR" ]; then + mkdir -p $LOG_DIR +fi + +# Constant data +MODELARRAY=("iid" "pi" "rho" "pirho") + +MODEL=${MODELARRAY[$(($((SGE_TASK_ID - 1)) % 4))]} + +# Finding directory +APPLICATIONS_DIR=$(echo "$BASE_DIR/code/applications") + +echo $APPLICATIONS_DIR + +Rscript "${APPLICATIONS_DIR}/weboflife/01_weboflife_clusterize.R" --model $MODEL