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Module 2 exo4 Analyse du journal
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6cecc8e0c2
commit
25f062425a
1 changed files with 35 additions and 73 deletions
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@ -1,6 +1,6 @@
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#+TITLE: Votre titre
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#+AUTHOR: Votre nom
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#+DATE: La date du jour
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#+TITLE: Analyse du journal
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#+AUTHOR: Louis Lacoste
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#+DATE: 2022-11-20
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#+LANGUAGE: fr
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# #+PROPERTY: header-args :eval never-export
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@ -11,83 +11,45 @@
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#+HTML_HEAD: <script type="text/javascript" src="http://www.pirilampo.org/styles/lib/js/jquery.stickytableheaders.js"></script>
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#+HTML_HEAD: <script type="text/javascript" src="http://www.pirilampo.org/styles/readtheorg/js/readtheorg.js"></script>
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* Quelques explications
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* Récupération des données du journal
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Ceci est un document org-mode avec quelques exemples de code
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python. Une fois ouvert dans emacs, ce document peut aisément être
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exporté au format HTML, PDF, et Office. Pour plus de détails sur
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org-mode vous pouvez consulter https://orgmode.org/guide/.
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Ici nous allons importer les étiquettes et les exporter dans un
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fichier =data.csv=.
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Lorsque vous utiliserez le raccourci =C-c C-e h o=, ce document sera
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compilé en html. Tout le code contenu sera ré-exécuté, les résultats
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récupérés et inclus dans un document final. Si vous ne souhaitez pas
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ré-exécuter tout le code à chaque fois, il vous suffit de supprimer
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le # et l'espace qui sont devant le ~#+PROPERTY:~ au début de ce
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document.
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Comme nous vous l'avons montré dans la vidéo, on inclue du code
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python de la façon suivante (et on l'exécute en faisant ~C-c C-c~):
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#+begin_src python :results output :exports both
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print("Hello world!")
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#+begin_src shell :results output :exports both
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grep -oP "(?<=:)([a-zA-Z]*)(?=:)" ~/org/journal.org > data.csv
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head -n 5 data.csv
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#+end_src
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#+RESULTS:
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: Hello world!
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: informatique
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: wikipedia
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: biologie
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: virus
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: allergie
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Voici la même chose, mais avec une session python, donc une
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persistance d'un bloc à l'autre (et on l'exécute toujours en faisant
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~C-c C-c~).
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#+begin_src python :results output :session :exports both
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import numpy
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x=numpy.linspace(-15,15)
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print(x)
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* Traitement des données
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#+NAME: import-python
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#+begin_src python :results output :session :exports both :dir /home/polarolouis/Documents/MOOC/RR/mooc-rr/module2/exo4
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import csv
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with open('data.csv', 'r', encoding='utf8') as csvfile:
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reader = csv.reader(csvfile)
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for row in reader:
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print(row)
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#+end_src
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#+RESULTS:
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#+RESULTS: import-python
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#+begin_example
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[-15. -14.3877551 -13.7755102 -13.16326531 -12.55102041
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||||
-11.93877551 -11.32653061 -10.71428571 -10.10204082 -9.48979592
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||||
-8.87755102 -8.26530612 -7.65306122 -7.04081633 -6.42857143
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||||
-5.81632653 -5.20408163 -4.59183673 -3.97959184 -3.36734694
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||||
-2.75510204 -2.14285714 -1.53061224 -0.91836735 -0.30612245
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0.30612245 0.91836735 1.53061224 2.14285714 2.75510204
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||||
3.36734694 3.97959184 4.59183673 5.20408163 5.81632653
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||||
6.42857143 7.04081633 7.65306122 8.26530612 8.87755102
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||||
9.48979592 10.10204082 10.71428571 11.32653061 11.93877551
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12.55102041 13.16326531 13.7755102 14.3877551 15. ]
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['informatique']
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['wikipedia']
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['biologie']
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['virus']
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['allergie']
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['biologie']
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['LOGBOOK']
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['END']
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['LOGBOOK']
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['END']
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#+end_example
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Et enfin, voici un exemple de sortie graphique:
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#+begin_src python :results output file :session :var matplot_lib_filename="./cosxsx.png" :exports results
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import matplotlib.pyplot as plt
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plt.figure(figsize=(10,5))
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plt.plot(x,numpy.cos(x)/x)
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plt.tight_layout()
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plt.savefig(matplot_lib_filename)
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print(matplot_lib_filename)
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#+end_src
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#+RESULTS:
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[[file:./cosxsx.png]]
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Vous remarquerez le paramètre ~:exports results~ qui indique que le code
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ne doit pas apparaître dans la version finale du document. Nous vous
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recommandons dans le cadre de ce MOOC de ne pas changer ce paramètre
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(indiquer ~both~) car l'objectif est que vos analyses de données soient
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parfaitement transparentes pour être reproductibles.
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Attention, la figure ainsi générée n'est pas stockée dans le document
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org. C'est un fichier ordinaire, ici nommé ~cosxsx.png~. N'oubliez pas
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de le committer si vous voulez que votre analyse soit lisible et
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compréhensible sur GitLab.
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Enfin, n'oubliez pas que nous vous fournissons dans les ressources de
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ce MOOC une configuration avec un certain nombre de raccourcis
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claviers permettant de créer rapidement les blocs de code python (en
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faisant ~<p~, ~<P~ ou ~<PP~ suivi de ~Tab~).
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Maintenant, à vous de jouer! Vous pouvez effacer toutes ces
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informations et les remplacer par votre document computationnel.
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