diff --git a/suivi/2025-51/2025-51.qmd b/suivi/2025-51/2025-51.qmd index 41cb1bb..17e5807 100644 --- a/suivi/2025-51/2025-51.qmd +++ b/suivi/2025-51/2025-51.qmd @@ -18,7 +18,9 @@ bibliography: references.bib - Petites opérations sur les OTUs (regarder la matrice dans les yeux): - Ranger les OTUs par variances (i.e. `sd(OTU_j)`) - - Dessiner les graphiques : $\Var[OTU] = f(\Esp[OTU]), \frac{\Var[OTU]}{\Esp[OTU]^2} = f(\Esp[OTU])$ et $\frac{\Var[OTU]}{\Esp[OTU]} = f(\Esp[OTU]) (\approx 1)$ si les données suivent une loi de Poisson. + - ✅ **Dans un RMD sur Human Microbiome Compendium** Dessiner les graphiques : $\Var[OTU] = f(\Esp[OTU]), \frac{\Var[OTU]}{\Esp[OTU]^2} = f(\Esp[OTU])$ et $\frac{\Var[OTU]}{\Esp[OTU]} = f(\Esp[OTU]) (\approx 1)$ si les données suivent une loi de Poisson. + - HMC sur-dispersés (au-dessus bissectrice) + - Enterotype phyloseq sous-disp - Regarder la proportion de 1. taxon rares, 2. zeros. - Faire des coupures selon niveaux taxonomiques et regarder si $\Var_{\text{intra}} \approx \Var_{\text{inter}}$ - *Bonus*: faire ça dans qmd et voir si forge permet gitlab pages