Finir le papier :
-- Re-structurer le plan, mon plan, Donnet et Barbillon, échelle méso et comparaison inter réseau et noeuds non partagés.
+- ❓ Fait ? Re-structurer le plan, mon plan, Donnet et Barbillon, échelle méso et comparaison inter réseau et noeuds non partagés.
- ✅ Partie Baldock: Ajouter l’ordre des modèles préférés et vérifier mais BICLsep < BICL pirho < BICL iid
- ✅ Toutes les simus en annexe. Envoyer Info transfer en annexe et remplacer par Network partitioning
Codes pour le papier :
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+- Nettoyer les scripts
+- Faire un joli README
+- ❓Faire des notebooks
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Maitriser graphtools de Peixoto pour essayer d’utiliser l’arbre taxonomique sur graphe de cooccurence inférer par SparCC
Maitriser SparCC
Faire LBM sur niveau taxonomique grossier, initialiser avec le résultat pour un niveau plus fin et ainsi de suite.
Clustering unipartite j’ai cassé une fonction de distance à vérifier et réparer
Pour clustering de collections sur données réelles :
→ L’intuition de Pierre semble être confirmé, les dissimilarités semblent arrêter de varier sensiblement pour de grandes valeurs (Q_1,Q_2).
👶 (délégué à stagiaire) Clustering sur Doré :
+👶 (délégué à Mona) Clustering sur Doré :
