From b011e6d08bf326b231b3f16464359e6758952efd Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Louis Date: Tue, 23 Dec 2025 13:41:19 +0100 Subject: [PATCH] Ajout prob computationnels --- suivi/2025-51/2025-51.qmd | 5 ++++- 1 file changed, 4 insertions(+), 1 deletion(-) diff --git a/suivi/2025-51/2025-51.qmd b/suivi/2025-51/2025-51.qmd index 2647d7a..41cb1bb 100644 --- a/suivi/2025-51/2025-51.qmd +++ b/suivi/2025-51/2025-51.qmd @@ -23,9 +23,12 @@ bibliography: references.bib - Faire des coupures selon niveaux taxonomiques et regarder si $\Var_{\text{intra}} \approx \Var_{\text{inter}}$ - *Bonus*: faire ça dans qmd et voir si forge permet gitlab pages -- Faire tourner un LBM sur Human Gut et voir si ça plante sinon: +- ✅ Faire tourner un LBM sur Human Gut et voir si ça plante sinon, **ça plante, la ram est surchargée.** + - ⌛ Je tente avec SparseBM de JBL sur Python - Faire LBM sur niveau taxonomique grossier, initialiser avec le résultat pour un niveau plus fin et ainsi de suite. +- Prendre jeu de données exemple de phyloseq : enterotype tourne, des jeux de données de Mahendra ne tourne pas (phase forward interminable) + - Relire @peixotoHierarchicalBlockStructures2014 - Regarder les gens qui citent les travaux de Peixoto