Pour application du modèle colBiSBM sur données interaction PP et pratiques agricoles

phylogénie
graphes
lbm
sbm
Auteur·rice
Affiliation

Louis Lacoste

MIA Paris-Saclay, INRAE, AgroParisTech, Université Paris-Saclay

Date de publication

7 mai 2026

Modifié

7 mai 2026

1 Idée de l’application

En discutant avec Alizée et grâce aux ressources de la section “Liens” données par Jean possible d’essayer de voir l’impact sur la structure des réseaux plantes-pollinisateurs des pratiques agricoles autour des espaces de pollinisation.

2 Point à éclaircir

  1. Quels réseaux plantes-pollinisateurs choisir, où les trouver ? Besoin de réseaux en France pour la facilité.
  2. Faut-il utiliser les covariables seulement de manière post-hoc pour corréler avec le clustering de réseaux obtenus ?
  3. Comment encoder les covariables ?
    • Est-ce que je les mets sous forme de pourcentage dans un buffer (quel rayon ?) comme Jean ? Alors problèmes inhérents aux données compositionnelles mais facilité d’exécution ?
    • Quelle distance considérer pour l’impact des pratiques agricoles, distance variables par pollinisateurs en soit ? Besoin de connaissances expertes.
    • Besoin d’homogénéiser les échelles ? Ou a minima d’en choisir une ou plusieurs à considérer pour les covariables ?
    • Gestion de gros tableaux de données pas simple.
  4. Le temps ???

3 Liens

CORINE Land Cover et extraction en R Très gros grain : https://fr.wikipedia.org/wiki/Corine_Land_Cover et le package de Jean pour l’extraction des buffers de types d’utilisation des sols : https://github.com/jean-cohen/corine.land.cover.landuse.extraction

Les cartes de données :