Bilan semaine 14 2025 : 24-28 mars

colBiSBM
Auteur·rice
Affiliation

Louis Lacoste

MIA Paris-Saclay, INRAE, AgroParisTech, Université Paris-Saclay

Date de publication

28 mars 2025

Modifié

13 août 2025

A faire

  • Relire intro St Clair

  • S’inspirer structure pour mon intro

  • Trouver biblio intro

  • Rédiger l’intro

  • Agrandir la collection d’application, pas seulement Baldock mais aussi Trojelsgaard par ex

  • Lire les papiers de Baldock Traveset Souza Cordeniz Trojelsgaard et Gibson

  • Présenter le réseau Afrique du Sud dès l’intro des réseaux anglais de Baldock

  • Corriger structure de simus :

    • Pour noisy \alpha :
      • Logit pour envoyer la gaussienne vers (0,1)
      • Beta contrainte dans (0,1)
    • Pour noisy links : Générer nb_clustering collections de taille M puis prélever \epsilon_{max}n_r n_c liens à inverser puis pour les \epsilon < \epsilon_{max} prélever dans la liste des indices afin d’avoir des perturbations emboitées.
  • Rédiger et modifier les cadres de simulations dans le papier pour qu’ils soient raccord avec les données obtenues.

  • Lancer clustering iid ascendant sur données sub-Doré.

  • Vérifier si les Baldock anglais ont des espèces en communs “Do they involve common species?”.

J’ai fait

  • Corriger structure de simus :
    • Pour NA robustness
  • Définir dans la section 3 :

Remark that for iid-colBiSBM, \pi_q, \rho_r > 0, and thus the blocks exist and are represented in all networks. For the other models, some blocks may not exist in some networks and this is why \pi_q^m, \rho_r^m \geq 0. Using S^{(1)} and S^{(2)} we can define the restricted parameters for each network and we denote them as \widetilde{\bm{\pi}}^m, \widetilde{\bm{\rho}}^m and \widetilde{\bm{\alpha}}^m. The restrictions thus indicate the blocks that are represented in the network m.

  • Écrire la partie preuve pour identif \pi-colBiSBM et \rho-colBiSBM. Identif : \pi et \rho en attente retours Pierre et Sophie

  • Saint-Clair va passer colSBM sous GrossSBM

  • Agrandir la collection d’application, pas seulement Baldock mais aussi Trojelsgaard par ex : Collection agrandie avec Baldock Traveset Souza Cordeniz Trojelsgaard et Gibson, en attente MIGALE. Clustering instable

A continuer

  • Résultats simus NA Erreur pour certaines conditions : Pour NA robustness générer nb_rep collections de taille M=2 et prélever \epsilon_{max}n_r n_c liens à retirer puis pour les \epsilon < \epsilon_{max} prélever dans la liste des indices afin d’avoir des perturbations emboitées. Il faut que j’ajoute un mécanisme pour reprendre des conditions qui ont plantés et que je skip dans le future_lapply les conditions déjà traitées (pour avoir la même seed quand je vais exécuter le code). Implémenté les missing steps en attente des résultats MIGALE.

  • Pour sub doré en attente MIGALE augmenter le nbre de répèt de la procédure.