1 line
No EOL
11 KiB
JSON
1 line
No EOL
11 KiB
JSON
{"title":"Bilan semaine 16 2025","markdown":{"yaml":{"title":"Bilan semaine 16 2025","categories":["colBiSBM"],"date":"18 04 2025"},"headingText":"A faire","containsRefs":false,"markdown":"\n\n\n- Relire intro St Clair\n- S'inspirer structure pour mon intro\n- Trouver biblio intro\n- Rédiger l'intro\n\n- Lire les papiers de Baldock Traveset Souza Cordeniz Trojelsgaard et Gibson\n\n- Corriger structure de simus :\n - Pour noisy $\\alpha$ : \n - Logit pour envoyer la gaussienne vers (0,1)\n - Beta contrainte dans (0,1)\n - Pour noisy links : Générer `nb_clustering` collections de taille M puis prélever $\\epsilon_{max}n_r n_c$ liens à inverser puis pour les $\\epsilon < \\epsilon_{max}$ prélever dans la liste des indices afin d'avoir des perturbations emboitées. \n\n- Idée Sophie: Regarder clustering de données plantes-pollinisateur selon gradient d'urbanisation\n\n- Idée Pierre : Regarder la contribution au BICL de la collection des réseaux \net comparer au sep BICL pour essayer de repérer les outliers.\n\n## J'ai fait\n\n- J'ai lancé le clustering iid ascendant sur données sub-Doré.\nRésultats stables mais 27 collections formées donc pas de mise en commun des structures...\n\n\n- Rédiger et modifier les cadres de simulations dans le papier pour qu'ils soient\nraccord avec les données obtenues.\n\n- Étoffer la partie simulations studies en mettant plusieurs points pour présenter les simus et les résultats succintement.\n\n> je pense qu'il faudrait étoffer en mettrant plusieurs points répartis en paragraphe. genre vérif selection de modèle verif clustering réseau, verif transfer leraning et de dire les résultats en qq mots\n\n- Comment faire pour l'inscription JdS (paiement, coldem ...) : voir avec Christelle\n- CSI : St Clair, Sonia ou Elisa et Pierre Gérard\n\n## A continuer\n\n - Résultats simus NA **Erreur pour certaines conditions** : Pour NA robustness générer `nb_rep` collections de taille $M=2$ et prélever \n$\\epsilon_{max}n_r n_c$ liens à retirer puis pour les $\\epsilon < \\epsilon_{max}$ prélever dans la liste des indices afin d'avoir des perturbations emboitées.\nIl faut que j'ajoute un mécanisme pour reprendre des conditions qui ont plantés et que je skip dans le future_lapply les conditions déjà traitées (pour avoir la même seed quand je vais exécuter le code). \nImplémenté les missing steps *en attente des résultats MIGALE*. \n\n- Lire Biological Networks - François Képès\n\n- J'ai esquissé des bouts d'intro\n\n","srcMarkdownNoYaml":"\n\n## A faire\n\n- Relire intro St Clair\n- S'inspirer structure pour mon intro\n- Trouver biblio intro\n- Rédiger l'intro\n\n- Lire les papiers de Baldock Traveset Souza Cordeniz Trojelsgaard et Gibson\n\n- Corriger structure de simus :\n - Pour noisy $\\alpha$ : \n - Logit pour envoyer la gaussienne vers (0,1)\n - Beta contrainte dans (0,1)\n - Pour noisy links : Générer `nb_clustering` collections de taille M puis prélever $\\epsilon_{max}n_r n_c$ liens à inverser puis pour les $\\epsilon < \\epsilon_{max}$ prélever dans la liste des indices afin d'avoir des perturbations emboitées. \n\n- Idée Sophie: Regarder clustering de données plantes-pollinisateur selon gradient d'urbanisation\n\n- Idée Pierre : Regarder la contribution au BICL de la collection des réseaux \net comparer au sep BICL pour essayer de repérer les outliers.\n\n## J'ai fait\n\n- J'ai lancé le clustering iid ascendant sur données sub-Doré.\nRésultats stables mais 27 collections formées donc pas de mise en commun des structures...\n\n\n- Rédiger et modifier les cadres de simulations dans le papier pour qu'ils soient\nraccord avec les données obtenues.\n\n- Étoffer la partie simulations studies en mettant plusieurs points pour présenter les simus et les résultats succintement.\n\n> je pense qu'il faudrait étoffer en mettrant plusieurs points répartis en paragraphe. genre vérif selection de modèle verif clustering réseau, verif transfer leraning et de dire les résultats en qq mots\n\n- Comment faire pour l'inscription JdS (paiement, coldem ...) : voir avec Christelle\n- CSI : St Clair, Sonia ou Elisa et Pierre Gérard\n\n## A continuer\n\n - Résultats simus NA **Erreur pour certaines conditions** : Pour NA robustness générer `nb_rep` collections de taille $M=2$ et prélever \n$\\epsilon_{max}n_r n_c$ liens à retirer puis pour les $\\epsilon < \\epsilon_{max}$ prélever dans la liste des indices afin d'avoir des perturbations emboitées.\nIl faut que j'ajoute un mécanisme pour reprendre des conditions qui ont plantés et que je skip dans le future_lapply les conditions déjà traitées (pour avoir la même seed quand je vais exécuter le code). \nImplémenté les missing steps *en attente des résultats MIGALE*. \n\n- Lire Biological Networks - François Képès\n\n- J'ai esquissé des bouts d'intro\n\n"},"formats":{"html":{"identifier":{"display-name":"HTML","target-format":"html","base-format":"html"},"execute":{"fig-width":7,"fig-height":5,"fig-format":"retina","fig-dpi":96,"df-print":"default","error":false,"eval":true,"cache":null,"freeze":"auto","echo":true,"output":true,"warning":true,"include":true,"keep-md":false,"keep-ipynb":false,"ipynb":null,"enabled":null,"daemon":null,"daemon-restart":false,"debug":false,"ipynb-filters":[],"ipynb-shell-interactivity":null,"plotly-connected":true,"engine":"markdown"},"render":{"keep-tex":false,"keep-typ":false,"keep-source":false,"keep-hidden":false,"prefer-html":false,"output-divs":true,"output-ext":"html","fig-align":"default","fig-pos":null,"fig-env":null,"code-fold":"none","code-overflow":"scroll","code-link":false,"code-line-numbers":false,"code-tools":false,"tbl-colwidths":"auto","merge-includes":true,"inline-includes":false,"preserve-yaml":false,"latex-auto-mk":true,"latex-auto-install":true,"latex-clean":true,"latex-min-runs":1,"latex-max-runs":10,"latex-makeindex":"makeindex","latex-makeindex-opts":[],"latex-tlmgr-opts":[],"latex-input-paths":[],"latex-output-dir":null,"link-external-icon":false,"link-external-newwindow":false,"self-contained-math":false,"format-resources":[],"notebook-links":true},"pandoc":{"standalone":true,"wrap":"none","default-image-extension":"png","to":"html","toc":true,"html-math-method":"katex","embed-resources":true,"output-file":"2025-16.html"},"language":{"toc-title-document":"Table des matières","toc-title-website":"Sur cette page","related-formats-title":"Autres formats","related-notebooks-title":"Notebooks","source-notebooks-prefix":"La source","other-links-title":"Autres liens","code-links-title":"Liens de code","launch-dev-container-title":"Lancer le Dev Container","launch-binder-title":"Lancer le Binder","article-notebook-label":"Cahier d'articles","notebook-preview-download":"Télécharger le cahier","notebook-preview-download-src":"Télécharger le code source","notebook-preview-back":"Retour à l'article","manuscript-meca-bundle":"Archive MECA","section-title-abstract":"Résumé","section-title-appendices":"Annexes","section-title-footnotes":"Notes de bas de page","section-title-references":"Les références","section-title-reuse":"Réutilisation","section-title-copyright":"Droits d'auteur","section-title-citation":"Citation","appendix-attribution-cite-as":"Veuillez citer ce travail comme suit :","appendix-attribution-bibtex":"BibTeX","appendix-view-license":"Voir la Licence","title-block-author-single":"Auteur·rice","title-block-author-plural":"Auteur·rice·s","title-block-affiliation-single":"Affiliation","title-block-affiliation-plural":"Affiliations","title-block-published":"Date de publication","title-block-modified":"Modifié","title-block-keywords":"Mots clés","callout-tip-title":"Astuce","callout-note-title":"Note","callout-warning-title":"Avertissement","callout-important-title":"Important","callout-caution-title":"Mise en garde","code-summary":"Code","code-tools-menu-caption":"Code","code-tools-show-all-code":"Montrer tout le code","code-tools-hide-all-code":"Cacher tout le code","code-tools-view-source":"Voir les sources","code-tools-source-code":"Code source","tools-share":"Share","tools-download":"Download","code-line":"Ligne","code-lines":"Lignes","copy-button-tooltip":"Copier vers le presse-papier","copy-button-tooltip-success":"Copié","repo-action-links-edit":"Modifier cette page","repo-action-links-source":"Voir la source","repo-action-links-issue":"Faire part d'un problème","back-to-top":"Retour au sommet","search-no-results-text":"Pas de résultats","search-matching-documents-text":"documents trouvés","search-copy-link-title":"Copier le lien vers la recherche","search-hide-matches-text":"Cacher les correspondances additionnelles","search-more-match-text":"correspondance de plus dans ce document","search-more-matches-text":"correspondances de plus dans ce document","search-clear-button-title":"Effacer","search-text-placeholder":"","search-detached-cancel-button-title":"Annuler","search-submit-button-title":"Envoyer","search-label":"Recherche","toggle-section":"Basculer la section","toggle-sidebar":"Basculer la barre latérale","toggle-dark-mode":"Basculer le mode sombre","toggle-reader-mode":"Basculer en mode lecteur","toggle-navigation":"Basculer la navigation","crossref-fig-title":"Figure","crossref-tbl-title":"Table","crossref-lst-title":"Listing","crossref-thm-title":"Théorème","crossref-lem-title":"Lemme","crossref-cor-title":"Corollaire","crossref-prp-title":"Proposition","crossref-cnj-title":"Conjecture","crossref-def-title":"Définition","crossref-exm-title":"Exemple","crossref-exr-title":"Exercice","crossref-ch-prefix":"Chapitre","crossref-apx-prefix":"Annexe","crossref-sec-prefix":"Section","crossref-eq-prefix":"Équation","crossref-lof-title":"Liste des Figures","crossref-lot-title":"Liste des Tables","crossref-lol-title":"Liste des Listings","environment-proof-title":"Preuve","environment-remark-title":"Remarque","environment-solution-title":"Solution","listing-page-order-by":"Trier par","listing-page-order-by-default":"Ordre par défaut","listing-page-order-by-date-asc":"Le plus ancien","listing-page-order-by-date-desc":"Le plus récent","listing-page-order-by-number-desc":"Descendant","listing-page-order-by-number-asc":"Ascendant","listing-page-field-date":"Date","listing-page-field-title":"Titre","listing-page-field-description":"Description","listing-page-field-author":"Auteur·rice","listing-page-field-filename":"Nom de fichier","listing-page-field-filemodified":"Modifié","listing-page-field-subtitle":"Sous-titre","listing-page-field-readingtime":"Temps de lecture","listing-page-field-wordcount":"Compteur de Mots","listing-page-field-categories":"Catégories","listing-page-minutes-compact":"{0} min.","listing-page-category-all":"Tous","listing-page-no-matches":"Aucun article correspondant","listing-page-words":"{0} mots","listing-page-filter":"Filtre","draft":"Brouillon"},"metadata":{"lang":"fr","fig-responsive":true,"quarto-version":"1.5.57","date":"18 04 2025","author":{"name":"Louis Lacoste","email":"louis.lacoste@agroparistech.fr","affiliation":"MIA Paris-Saclay, INRAE, AgroParisTech, Université Paris-Saclay","orcid":"0009-0004-0178-9821"},"theme":"yeti","title-block-banner":true,"title":"Bilan semaine 16 2025","categories":["colBiSBM"]},"extensions":{"book":{"multiFile":true}}}},"projectFormats":["html"]} |