Louis Lacoste
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Affected files: .obsidian/types.json .obsidian/workspace.json Thèse/Articles/Review papier colBiSBM.md Thèse/Axes/Phylogénie/SBM avec covariance latente.md Thèse/Projets annexes/Application colBiSBM réseaux d'optimisation de NN.md Thèse/Projets annexes/Applications colBiSBM pour impact pratiques agris sur interactions plantes pollinisateurs.md Thèse/Projets annexes/VGAE avec (Gromov-)Wasserstein.md Thèse/Résolution des problèmes/Problème avec renv.md
2.3 KiB
| title | categories | author | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Pour application du modèle colBiSBM sur données interaction PP et pratiques agricoles |
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{{< include /_macros.tex >}}
TODO
- Écrire un script pour télécharger les données des diverses sources
- Écrire un script de prétraitement des données pour les mettre au bon format
- Appliquer colBiSBM sur les réseaux
Idée de l'application
En discutant avec Alizée et grâce aux ressources de la section "Liens" données par Jean possible d'essayer de voir l'impact sur la structure des réseaux plantes-pollinisateurs des pratiques agricoles autour des espaces de pollinisation.
Point à éclaircir
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Quels réseaux plantes-pollinisateurs choisir, où les trouver ? Besoin de réseaux en France pour la facilité.
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Faut-il utiliser les covariables seulement de manière post-hoc pour corréler avec le clustering de réseaux obtenus ?
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Comment encoder les covariables ?
- Est-ce que je les mets sous forme de pourcentage dans un buffer (quel rayon ?) comme Jean ? Alors problèmes inhérents aux données compositionnelles mais facilité d'exécution ?
- Quelle distance considérer pour l'impact des pratiques agricoles, distance variables par pollinisateurs en soit ? Besoin de connaissances expertes.
- Besoin d'homogénéiser les échelles ? Ou a minima d'en choisir une ou plusieurs à considérer pour les covariables ?
- Gestion de gros tableaux de données pas simple.
- Le temps ???
Liens
CORINE Land Cover et extraction en R
Très gros grain :
https://fr.wikipedia.org/wiki/Corine_Land_Cover et le package de Jean pour l'extraction des buffers de types d'utilisation des sols :
https://github.com/jean-cohen/corine.land.cover.landuse.extraction
Les cartes de données :
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Carte du Bio et des types de cultures échelle parcelle : https://www.agencebio.org/cartobio/
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Échelle code postal, achat de phytosanitaires : https://ventes-produits-phytopharmaceutiques.eaufrance.fr/
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Thèse de Milena Cairo, classification des parcelles selon les pratiques en pesticides : https://theses.hal.science/tel-05038286
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Recensement des parcelles et du type de culture : https://cartes.gouv.fr/rechercher-une-donnee/dataset/IGNF_RPG?redirected_from=geoservices.ign.fr