polarolouis/Louis
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Louis/Thèse/Packages/R/colSBM.md
Louis 3ec902f3f6 vault backup: 2026-06-15 14:41:32 
Affected files:
.obsidian/workspace.json
Thèse/Packages/R/colSBM.md
Thèse/Projets annexes/Application colBiSBM réseaux d'optimisation de NN.md
2026-06-15 14:41:33 +02:00

2 KiB
Raw Blame History

Implémentation en R des modèles #colSBM

Améliorations

  • Ajouter les checks d'identifiabilité dans le package en tant que fonctions appellables
  • Généraliser la manière de stocker et travailler avec différents modèles
  • Implémenter les estimations pour les distributions ⛔ 417egt
    • (colSBM) Catégorielle
    • (colSBM) Gaussienne
    • (colSBM) Binomiale négative
  • Pour améliorer implémenter un hachage avec rlang::hash #plus-tard
    • Comparer la vitesse entre le hachage et la méthode sans

Hachage

  1. Générer un hash dans fitBipartiteSBMPop à partir des matrices de tau et le rendre accessible depuis $hash
  2. Stocker une base des hash déjà rencontrés dans bisbmpop. Approche moins 'flexible' que les ARIs met qui devrait permettre de gagner de la vitesse

Avantage: Possible de passer la table de hachage à des sous-modèles ? Pour le partitionnement par exemple ?

Bugs

Merging models vapply

Je rencontre un bug que j'ai fréquemment eu sur Migale:

Merging the 3 modelsErreur dans vapply(models_comparison, function(model) model$BICL, FUN.VALUE = 0.1) : 
  values must be length 1,
 but FUN(X[[2]]) result is length 0
Appels : lapply -> FUN -> <Anonymous> -> vapply
De plus : Il y a eu 50 avis ou plus (utilisez warnings() pour voir les 50 premiers)
Exécution arrêtée
  • Essayer de reproduire l'erreur de vapply pour la réparer 🆔 ckx0ew ✅ 2026-06-15
    • Modulariser la fonction de fusion des réseaux pour pouvoir implémenter le test unitaire ✅ 2026-06-11
    • Ajouter la même suppression pour discarded que pour compared ✅ 2026-06-11
    • Améliorer la fusion des runs pour conserver à chaque (Q_1,Q_2) les modèles ⛔ 50v6w4 ✅ 2026-06-11
    • Implémenter le nouveau merge dans le package et vérifier que tout fonctionne normalement ✅ 2026-06-13
  • Implémenter un test unitaire pour prévenir la régression ⛔ ckx0ew ✅ 2026-06-13

La réimplémentation semble avoir réussie à éliminer ce bug.