Louis/Thèse/Séminaires/2026-06-09 VICTOR François.md
2026-06-09 14:45:18 +02:00

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Titre::

Speaker:: François Victor

Lieu:: AgroParisTech

Date:: 2026-06-09

Contribution::

:::

Prise de notes

Contexte

  1. Stabilité phénotypique pour résister aux aléas et maladies
  2. Sélection variétale

Modèle mixte pour la stabilité phénotypique (Axe 1)

Données issues d'essais multi-environnement différents lieux, années, plantes et conditions. Modéliser par des modèles linéaires à effets mixtes.

Y_{gr}=\nu + \alpha_{g} + \mu_{e }+U_{ge} + E_{ger}

  • La matrice U doit être un compromis entre la param et le cout de l'inversion.
  • Nouveauté la variance (terme diagonal) est fonction de génotype et de l'environnement contrairement à la littérature.

Inférence par maximum de vraisemblance avec différentiation automatique.

Apprentissage par transfert (Axe 2)

Fort coût des données multi-environnement donc idée entrainement sur données américaines puis transfert sur européennes.

Les distributions sont différentes et les variétés sont différentes.

Décalage de domaine avec hypothèse de covariate shift:

p_{s}(y)\neq p_{t}(y), p_{s}(y|x)= p_{t}(y|x)

Estimation de l'importance par méthode KLIEP

Par minimisation de la divergence de #Kullback-Leibler

Perspectives

Relacher le covariate shift: car on sait que populations sélectionnées pour des traits génétiques différents.