polarolouis/these-recap-hebdo
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Louis 2025-12-23 13:41:19 +01:00
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suivi/2025-51/2025-51.qmd
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@ -23,9 +23,12 @@ bibliography: references.bib
- Faire des coupures selon niveaux taxonomiques et regarder si $\Var_{\text{intra}} \approx \Var_{\text{inter}}$
- *Bonus*: faire ça dans qmd et voir si forge permet gitlab pages
- Faire tourner un LBM sur Human Gut et voir si ça plante sinon:
- ✅ Faire tourner un LBM sur Human Gut et voir si ça plante sinon, **ça plante, la ram est surchargée.**
- ⌛ Je tente avec SparseBM de JBL sur Python
- Faire LBM sur niveau taxonomique grossier, initialiser avec le résultat pour un niveau plus fin et ainsi de suite.
- Prendre jeu de données exemple de phyloseq : enterotype tourne, des jeux de données de Mahendra ne tourne pas (phase forward interminable)
- Relire @peixotoHierarchicalBlockStructures2014
- Regarder les gens qui citent les travaux de Peixoto